병원 검사실에서의 감염성 질환의 진단은, 검체의 배양에 의한 감염원 검출과 형태학적, 생화학적 및 대사상 특징이나 혈청학적 반응상과 같은 표현형 검사(phenotype test) 에 대부분 의존한다. 전통적인 표현형 검사는 1) 배양 조건이 까다로와 기존 방법에 의하여 배양이 불가능한 감염원 2) 장시간 소요 3) 배양조건에 의한 표현형의 변화 4) 다양한 유전자 및 유전자 조합에 의해 동일 표현형이 발현할 수 있다는 단점이 지적되고있다. (Korean J Clin Microbiol 2002;5(1):1-5)