진단에 유용한 미생물학적 검사의 기본목표는 특정 병원균을 신속히 검출하고 그 특징을 규명하여 환자가 잘 치료될 수 있도록 도와주는데에 있다.  지난 세기에 미생물의 동정은 배양한균의 형태와 생화학적 특징과 같은 표현형의 특성(phenotypic characteristics)에  근거를 두어 시행되어 왔으나 균성장에 근거를 둔 방법은 때로 시간이 많이 들거나 값이 비싸고 어떤 미생물에는 쉽게 이용할 수 있는 방법이 없다는 단점이 있다.